C’est la rentrée. Au retour des vacances, qui ont été plutôt calmes, les héros sont de nouveau confrontés à Xana dont ils entrevoient les nouveaux enjeux : faire disparaître Lyokô en détruisant une sphère située dans une salle jusqu’alors inconnue du 5ème territoire : le cœur même du monde virtuel ! Parallèlement, Odd constate avec effroi qu’il n’est pas dans la même classe que Jérémy, Ulrich et Aélita. Catastrophe ! Mais il découvre également que Jim a été acteur dans un film de danse disco… et que le prof de gym n’a guère envie que cela se sache au sein du collège Kadic. Fort de ce secret, Odd décide de faire du chantage à Jim pour essayer de réintégrer la classe de ses copains…