Jérémy Belpois est souvent jugé comme "l'intello" du collège. En effet, Jérémy est un enfant surdoué, mais surtout un petit génie de l'informatique. Modeste et effacé au quotidien, Jérémy passe beaucoup de temps derrière son ordinateur. Il est le maitre du labo et supervise avec aisance les transferts de ses amis sur Lyoko. Il les aide à éviter les monstres et à déjouer les pièges de X.A.N.A., et toute l'équipe lui obéit en toute confiance.Ayant réussi à matérialiser Aelita, pour qu'elle mène une vie d'humaine avec ses amis, Jérémy appé;cie particulièrement sa compagnie et l'aide à s'adapter à sa nouvelle vie. Sa générosité et son amitié pour Aelita le pousse à continuer ses recherches informatiques et espère pouvoir encore aider Aelita dans la quête de son passé.
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Odd Della Robia a été élevé par des parents artistes, lui donnant le goût de la liberté et un esprit curieux. Mauvais élève, il s'intéresse aux matières artistiques et ludiques telles que la peinture, la mode, et surtout la musique. Et cela se traduit par son look branché et son caractère jovial et original. Il partage sa chambre au pensionnat avec Ulrich et son chien Kiwi, qu'il garde en secret sous son lit. Toujours de bonne humeur, Odd adore se moquer des autres et leur faire des blagues. Joyeux et espiègle, Odd est le moins mature du groupe et notamment sur Lyoko. Aveugle face au danger, il fonce souvent tête baissée. Heureusement ses amis sont là pour le sauver des pièges de X.A.N.A.
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Yumi Ishiyama, née au Japon, a reçu une éducation traditionnelle japonaise, et accorde beaucoup d'importance à ses origines. Elle vit chez ses parents avec son petit frère Hiroki, non loin du collège. Très mature, elle prend le temps de choisir ses amis et déteste les enfantillages. Avec son humour fin et son sens de l'observation, Yumi cerne facilement les gens et sait leur répondre avec assurance et ironie. Les autres la considèrent comme le chef du groupe: de nature charismatique, Yumi impose le respect et sait prendre les décisions de terrain importantes. Derrière sa carapace distante et froide, Yumi cache une grande gentillesse et une forte capacité à comprendre et à aider ses amis. Elle est très proche d'Ulrich, mais cette relation forte et complexe est souvent menacée par le beau William.

Ulrich Sterne partage sa chambre avec Odd (et Kiwi) au pensionnat, mais reste toujours très pudique avec ses émotions et très réservé, voire mystérieux. Sa maitrise de lui-même vient sans doute du fait qu'il pratique quotidiennement une discipline rare et noble: le Pentchak-silat. Cet art martial d'origine asiatique, se caractérise par la rapidité et la fluidité des mouvements. Sur Lyoko, Ulrich n'en est que plus courageux et plus efficace. Il sait garder son sang-froid quelques soient les nouvelles attaques de X.A.N.A. Au collège, quand Sissi lui tourne autour, il sait jouer le bel indifférent. Mais quand Yumi est dans les parages, le samouraï perd tous ses moyens, et encore plus quand il la voit avec le beau William.

Aelita est une jeune humanoïde virtuelle, qui vivait sur Lyoko, se battant seule contre X.A.N.A. Dè sa rencontre avec Yumi, Jérémy, Odd et ulrich, ils deviennent amis et lui font la promesse de la libérer du virus. Ensemble, ils combattent les monstres de X.A.N.A. et déjouent ses plans maléfiques. Aelita est la seule à pouvoir stopper ses attaques, en désactivant les tours infectées de Lyoko. Lorsque Jérémy trouve enfin la formule informatique pour matérialiser Aelita, elle rejoint ses amis sur Terre et devient une collégienne "presque" normale. Aelita, assez timide et fragile, découvre la vie humaine avec émerveillement. Mais très vite son quotidien est hanté par d'étranges visions et de violents cauchemars. Petit à petit, la mémoire lui revient, et avec l'aide de Jérémy qui essaye de décrypter le mystérieux journal de Franz Hopper, nos héros comprennent alors qu'Aelita n'est pas d'origine virtuelle, mais la fille de Franz Hopper, le créateur de Lyoko.
Elle peut désormais vivre sur Terre en toute liberté, mais son combat contre X.A..N.A. est loin d'être terminé.